Внедрится в структуру

Здравствуйте.
Есть контроллер домена на винде server 2008 R2(менять ничего не могу, т.к. Москва :() Задача в следующем: поднять джаббер и прокси сервер в существующей инфраструктуре.

1. Можно ли автоматическим путем перетянуть юзеров и группы из домена?
2. Настроить прокси через доменную авторизацию (виндовую)
3. вогнать CDS в виндовый домен
4. изменить имя calculate на свое
5. Как попасть в джаббер сервер. Каким клиентом лучше пользоваться?

Поддержки ввода CDS в домен винды нет. Можно сделать только наоборот. Скрипта переноса пользователей тоже нет. Прокси можно настроить только с учётками пользователей CDS.

изменить имя calculate на свое

cl-setup --help-samba
...
  -n, --netbios NETBIOS_NAME     имя netbios, по умолчанию - имя хоста
  -w, --workgroup WORKGROUP      рабочая группа, по умолчанию 'Calculate'

Как попасть в джаббер сервер. Каким клиентом лучше пользоваться?

Любой, поддерживающий XMMP протокол. Под линуксом это Pidgin, Kopete и др.

Я понимаю, что любой поддерживающий XMMP протокол. Подключаться по ip или имени хоста?

Если настроен DNS, то можно и по имени хоста.